La cuenca Combeima presta innumerables servicios ambientales al Tolima, al surtir el 80% de los acueductos de la capital musical. En su zona amortiguadora, se consolidan esfuerzos por parte de CORTOLIMA en cuanto a la protección, conservación y recuperación de áreas con ecosistemas frágiles donde se albergan especies de flora y fauna nativas como los páramos y bosques.
Un estudio de Biodiversidad Faunística de la Cuenca Mayor del río Combeima, realizado por Cortolima y la Universidad del Tolima, determinó que esta cuenca es la más biodiversa. Tiene 75 especies de aves de las 297 reportadas, 24 reptiles de los 30 reportados, 35 anfibios de los 41 reportados y la mayor abundancia de murciélagos. Así mismo, se estableció que existen ocho unidades climáticas, cada una con su vegetación característica.
La educación ambiental, también tiene una participación clave a la hora de concientizar a las comunidades sobre el cuidado de la fuente hídrica; como el desarrollado con jóvenes y docentes de la institución educativa ambiental Combeima, quienes explicaron el porqué es necesario tomar acciones correctivas frente a la protección de la cuenca. Pronunciamiento hecho en el marco de la conmemoración del día cívico del rio combeima.
CORTOLIMA a trabaja en proyectos de reforestación, con tipos de especies productor protector (especialmente en las reservas forestales, en nacimientos y márgenes de las cuencas).
La compra de predios es otro mecanismo adoptado por la entidad para integrar el Sistema Regional de Áreas Protegidas del Tolima.